Sucinto Reporte de Actividades del día Sábado 24 de Mayo del 2008

El día de ayer, me robé el estereoscopio del laboratorio, la lámpara de luz incandescente y urgué entre todo el desmadre que tengo de papeles y copias que he sacado a lo largo de mi carrera como Biólogo y agrupé las claves taxonómicas de grupos de insectos. Abrí unas cheves (aprox. unas 6) que me engullí una tras otra mientras batallaba para identificar a este animalito que tengo a mi izquierda en el texto, que resulta ser un coleoptero de la familia Bostrichidae cuyas características morfológicas para identificarlo a nivel de familia son:

1)Prolongaciones en forma de cuerpo en la porción anterior del pronotum

2)En la parte posterior de los élitros estructuras también parecidas a cuernos, o tubérculos.

3)No recuerdo la tercera pero podría ser antena clubeada o base del pronotum más angosta que los élitros que poseen punteaduras cuadrangulares.

Lo encontré en Santiago N.L., creo que en un tronco muerto hurgando entre la madera, no recuerdo bien porque todos los bichos los metí en un bote y se revolvieron, pues estaba juntándolos por kilo.

Fue francamente muy divertido pasarme las dos o tres horas que me tardé en identificarlo, pues soy novato y era sábado en la noche o sea momento relax para un biólogo comprometido como yo (si ombee).

Moraleja, si te vas a hacer pendejo, haste tal en algo que valga la pena, que construya y que te permita aprender algo nuevo y con posible utilidad. Quién sabe si en el futuro resulto un Coleopterólogo famoso. Pude haberme ido a la presa a embriagarme, desmañanarme y terminar exactamente como empezé pero con una deuda de 4 o 5 horas que nadie me va a reponer.

Moraleja #2, procura no hacerte pendejo.

Sehr geehrte Fauler Säcke,

Este tipo es admirable. Se llamó Goethe. Dicen que era un genio, un "Universalintellektueler" como mi ex-maestra-por-un-tiempo de alemán le llamaba.

Lo que resaltaba de él, aparte de que era un cuerdita claro, es que le tiró a todo, y a todo le dió.

Fue científico, fue poeta, escribió "Roman"´s o novelas en alemán, sé por mi parte que le pegó a la botánica y a la física de Newton. Hasta bien viejero era el wey.

Los alemanes todavía lo consideran su más grande poeta. Hasta Nietzche, que a todo le tiraba mierda lo reconocía como un tipo genial, superior.

Así me siento yo, como mi cuate Johann.

Pero no por lo cuerda, sino porque le tiro a todo. Y me doy cuenta, cuando lo hago, que no soy Goethe. Ni en lo malo me le acerco siquiera, ya que soy un fanático de la monogamia, y lo desordenado a veces se me hace pues, entretenido (alles hässliche, alles unordung war für ihn verhasst).

Me siento cansado de querer todo, y dejar tan poco tiempo para lo que A MÍ me importa. No he estudiado molecular porque salgo de clase me voy al alemán me salgo del alemán temprano para ir a junta de representantes la termino apurado porque tengo que llegar al laboratorio porque programé un PCR me habla Nallely me dice que el evento de la semana que entra (que se llama "La Biología y los Niños", está muy bonito una vez que pase pongo fotos) es un caos que faltan camisas que saque lana voy corriendo a la casa saco lana pero antes regreso corriendo al laboratorio para cambiar la hora a la que programé el PCR todo este tiempo pienso en el examen de Biología Molecular en el Quijote que no se acaba en el libro de cordados que llevo tres días leyendo en lapsos de 20 minutos en la visa alemana y de repente, me detengo,

me siento en la computadora, me acuerdo de Goethe, me acuerdo que leí, con calma, que el nunca sería un ejemplo de lo perfecto (de lo que tanto hablaba pues era fanático de la perfección) porque como todo gran hombre no supo encontrar la perfección de sus ideas implementada en su propia vida.

Nunca fue fiel, aunque hablara del amor.

Nunca encontró esa belleza monumental de la que hablaba, en su vida diaria.

Calma, calma,

Lo que menos ha de haber tenido el Johann, a mi más me lo recuerda.

Tschüs...

Bioinformatics RULESSSSS!!!!

(Una pitoncita de 6 mts botaneándose una cabra, borrego o sheep en inglés no me acuerdo qué es en español)

Ayer al calor del festejo del día de las madres, con la inspiración que proporciona el atragantarte unas 6 cervezas emprendí lo que es el comienzo en mi carrera como bioinformático aprendiendo Python, un lenguaje que dicen los que saben se recomienda para los que queremos meternos a la de awebo al mundo de la informática y no tenemos experiencia mas que en Paint y en el buen Solitario.

Me puse una excelente maniaqada practicando el lenguaje este que les platico, en mi casa corro el Knoppix que trae instalado el Python (en windows también se puede pero le quise pegar al misterioso usando Linux) y encontré desde la página de python que es

http://www.python.org/

un tutorial para brutos como su gentil y valeroso servidor enfocado a los biólogos, y el tutorial lo
creo el instituto Pasteur y está bieeeen chido, para Dummies. Lo genial es que te van enseñando los fundamentos de programación (qué es un valor string, integer, como utilizarlos la sintaxis bla bla bla) y todo con ejemplos de secuencias de dna (ctatcgtatcgtatctgatctttaaccgcg).

Entonces comprenderán los que me conocen y saben mi modus funcionalis (entre más me emociono más borracho me pongo) que terminé groseramente confundido y picado en demasía,
no le di muy duro perdí capacidad de razón cuando llegué a la parte del tutorial en el que pedía que crearas un algoritmo para obtener el complemento reverso de una secuencia X.


He encontrado mi hobby perfecto, agradezco y elevo alabanzas y libaciones a los que se encuentran sentados en el Olimpo, por concederme tal actividad que me permitirá pasar abundantes horas de soledad en profunda meditación, perfecta actividad para pasar un sábado aburrido en la casa echando unas cheves y sacando algoritmos pa hacer análisis de DNA.

Dios bendiga los días que nos ha regalado, que en verdad son buenos.

De aquí en diez años se acordarán de mi, cuando me haga rico con mi compañía de biosoftware "Evosoft", monopolio que se adueñara del mundo y me tendrá podrido en billetes.

Y si no sale nada de eso pos de perdido me doy unas buenas y ñoñas divertidas.

El link pa el tutorial de el pasteur:

http://www.pasteur.fr/formation/infobio/python/

tschüs,

Sábados en la Ciencia... unas cheves

Sabadito día de las Madres, felicito a mi felice y fermosa procreadora por este
día que conmemora la joda que se tienen que aventar pa cuidarnos a toda la bola de
sierpes que nos pasamos un cuarto o un tercio a veces de nuestra vida friegue y friegue y friegue para que ellas sigan igual de gustosas que cuando nos trajeron al mundo.

Te quiero Mucho Mami, si es que llegas a leer esto.

Otra vez en el lab, pero afortunadamente gracias a mi Madre nadamás voy a estar una hora, terminando mi extracción de DNA de mis jodidas larvas de crisopa.

Va a haber un curso de Bioinformática, justo lo que he estado esperando (programación en Perl, PAUP, bioinformática en Unix) y resulta que esa semana, porque el curso es de una semana de duración, viene la Honorable Veneranda Dra. Margulis y su compinche el Dr. Lazcano. Así que me veo en un dilema ya que traer y organizar una conferencia con tales personalidades es algo valiosísimo para mi carrera ya que me conecta con gente influyente en el medio, me permite conocer a personalidades de la ciencia y me abre oportunidades para el futuro, pero y luego la ciencia qué?

Y mis cincuenta mil pesos qué??

Prácticamente toda la experiencia (corta, por supuesto) que he tenido en trabajando en un laboratorio ha sido relacionado con los métodos de inferencia filogenética y manejo de secuencias en paquetes de bioinformática, y esta ocasión viene un tipo muy ducho para este rollo de la evolución molecular que va a explicar desde como utilizar los programas (que no tiene nada de chiste) a como interpretar los resultados y los algoritmos en los que están basados.
Y también es cierto que me la paso jugando a querer aprender programación y a picarle al linux y bla bla bla que las matemáticas son muy importantes para ejercer ciencia,

Y el dilema pues: Atacar el mundo de la ciencia desde el frente de las relaciones públicas ó
Atacar el mundo de la ciencia desde el frente de la joda que es arender ciencia, sentadote y estudiando cosas dignas de ser interpretadas por un oráculo del antiguo Egipto o algún freak personaje de las caricaturas que ve Yuca (Metal Alchemist y esas cosas)

Por lo menos, si el dilema no va a poder resolverse o no está en mis manos resolverlo por lo menos algo sé, que lo que si es cierto, independientemente de cualquiera de las dos que pase, estoy en el sendero de la ciencia a paso firme...

Que ñoñooo
Bye voy a centrifugar

Endlich!!!! Etwas zu arbeiten!!

Bueno sería tuviera alguien que comentara sobre el post del día anterior, oscuro, triste, árido...
Pero que se puede esperar escribir cuando lo hace uno a las 11 de la noche en vísperas de un examen y un trabajo no terminado y a todo esto le añadimos unos tekilitas pa conciliar el sueño.

Pero possss ya es de día, estoy otra vez en el laboratorio (así es, aunque no tenga talento tengo trabajo, al menos) y es un día de esos light porque mi única chamba es dejar mis larvitas de Ceraeochrysa en un buffer de lisis, toda la noche en el Shaker, cosa que me lleva a lo mejor 20 minutos y el día de mañana hacer la extracción de DNA y volver a usar las horas de la noche pa un PCR y a este ritmo pal fin de semana que viene ya tengo mi artículo publicado.

Pos no, claro que no pero probablemente ya tengo secuencias de un gen y faltan nadamás 2 (genes).
Y ya teniendo todas las secuencias, a darle a la bioinformática duro, alineando y otras cosas que te permiten estar jugando al biólogo con la computadora.
Está excelente ese rollo de la bioinformática, eleva el ego y hace que la demás gente crea que eres de esos tipos que están a la vanguardia, siempre acercando la frontera de la ciencia.

Pero pos pa moverle a la bioinformática el único requisito es tener previa experiencia en Solitario y paint. Es verdad, lo acepto, lamento si hiero la sensibilidad y el sentido de pertenencia de algunos.

Heute ist eine schöner Tag, wirklich!!

Y la sociedad de Biólogos cada vez se hace algo más real en mi cabeza, cada vez deseo con mayores juerzas que se concrete. Puede llegar a ser algo que sirva, es bonito sentirse parte de algo que sirva.

Espero con esto haber compuesto el humor oscuro seco triste del post de ayer (lamento mis humores, i´m an addict in permanent recovery), y me presento con mi humor más ligero, somero y poco trascendental.

Tschüs meinen liebten Fauler Säcke!!